硅藻土的吸附性能与它的物理结构和化学结构密切相关，一般来说，比表面积越大吸附量越大；孔径越大，吸附质在孔内的扩散速率越大。硅藻土表面为大量硅羟基所覆盖，并有氢键存在，羟基也在硅藻土细孔内表面分布，这些羟基是硅藻土具有表面活性、吸附性的本质原因，表面的羟基越多，则吸附性能也越好。
      硅藻土的物理吸附过程：空气中的水分子和有害气体分子在永小停息的运动着，不断碰撞硅藻土壁材表面，当碰到大孔时，多数被返回到空气中；碰到孔径小于分子直径的孔时，或未碰到孔时便弹回空气中；而当碰到孔径约为分子直径倍的微孔时，便进入了孔隙中，被硅藻土分子吸住而难于跑出，这些分子又被接着来碰的分子碰着向孑L深处推移，直至孔隙被这些分子填满为止。